第十二季新角色盧克一開場便加入團(tuán)隊，之后史蒂芬也加入了團(tuán)隊，艾米莉也回歸了，摩根最后一集客串了一下，不過霍奇卻為了保護(hù)兒子而離開團(tuán)隊（其實是扮演者在片場把編劇打了，于是被迫下線），主角團(tuán)也開始搜捕上一季越獄逃走的十二個犯人，以及其他不少的案件，其中必然有不少案件知識還有心理學(xué)知識，有些人是天生的惡魔，有些人則是被心理陰影所困，而上一季逃走的犯人“刮擦先生”一直在虐待主角團(tuán)，凱特和林賽兩個曾經(jīng)的反派也加入進(jìn)來，小天使的瑞德還被害入獄了，各種被虐，監(jiān)獄真是可怕啊，犯人各種糟糕也就算了，獄警也是各種壞，本來的好人也可能變成壞人，故事也在監(jiān)獄和外面案件之中來回跳躍。劇情中還有不少社會問題的展示，比如家暴、校園暴力、宗教狂熱者、家教問題、極端環(huán)保主義、仇視女性者、夢游問題等。